La présence humaine à Ein Gedi remonte au moins à 5000 av. J.-C., ainsi que l'attestent les ruines du petit temple chalcolithique au-dessus de la source qui a donné son nom au site. C'est ici selon la Bible que se serait réfugié David, poursuivi par le roi Saül. C'est également dans une grotte d'Ein Gedi que s'est réfugié Simon Bar Kochba, le chef de la révolte contre les Romains en 132 de notre ère. La présence juive à cet endroit dura jusqu'au VI^e siècle. Le site fut ensuite abandonné jusqu'à ce que des militaires israéliens le réoccupent après la guerre d'Indépendance, puis qu'un kibboutz y soit fondé en 1956. Aujourd'hui, Ein Gedi est un site touristique important, qui jouit d'un climat chaud toute l'année et qui mise à la fois sur les cures thermales au bord de la mer Morte et sur les possibilités de balades au coeur de la végétation luxuriante qui entoure les ruisseaux et cascades de la réserve naturelle. Le site présente, sur un petit espace, des milieux naturels très divers. On peut y observer, entre autres, des plantes tropicales, désertiques, steppiques et méditerranéennes. Les randonneurs pourront également observer, avec une relative facilité, la faune du désert de Judée et notamment des bouquetins. Ceux-ci descendant en journée jusqu'aux abords du Kibbutz. Les prédateurs sont eux plus discrets, ne quittant bien souvent leurs refuges rocheux qu'à la nuit : deux espèces de renards (roux et afghan), la hyène rayée, le loup et le léopard sont présents. Quatre léopards se partagent le territoire de la réserve, où ils se nourrissent d'oiseaux, de damans et de bouquetins.