PORT
Ferries. Athènes. De deux à quatre ferries par jour depuis Le Pirée (de 7 à 10 heures de traversée) avec des escales fréquentes à Naxos, Paros, Ios, et moins régulièrement à Sikinos, Folegandros et Milos. Aucun ferry ne relie Santorin depuis Rafina. Certains ferries s’arrêtent au pied du village d’Ia avant d’accoster, à 30 minutes de là, à Athinos, le port principal de l’île.
Cyclades. Vers le nord-est, Ios (2 heures de traversée), Naxos (3 heures) et Paros (4 heures) sont les mieux desservies, notamment par les ferries venant d'Athènes. Mykonos est à 5 heures. Au nord-ouest, on compte des liaisons avec Sikinos (2 heures), Folegandros (2 heures 30), Milos (5 heures), Kimolos (5 heures 30), Sifnos (8 heures), Sérifos (9 heures) et avec Kythnos (10 heures). Très excentrée par rapport aux autres Cyclades, Anafi devient facile d'accès à partir de Santorin, puisqu'elle est n'est qu'à 1 heure 30 de ferry.
Hydroglisseurs. L'île est reliée par hydroglisseur de 2 à 3 fois par jour depuis Le Pirée et 1 fois par jour depuis Rafina. La travervée dure de 5 à 6 heures selon les escales. Sont aussi desservies Ios, Naxos, Mykonos, Paros, Sikinos, Sifnos, Sérifos et la Crète.