Personne ne connaît avec exactitude la date de fondation de cette cité. Certains historiens situent ses origines au XI^e siècle, à l'époque des Chauhan. Elle rentre dans l'histoire documentée lorsque Mohamed Khan, premier nawab de la dynastie Kaimkhani, s'en empare aux alentours de 1450 pour en faire une principauté musulmane. Reconquise en 1730 par Sardul Singh, elle devient la capitale du Shekhawati. Durant cette époque, deux familles de marchands, les Tulsian et les Khaitan, transforment la ville en érigeant plusieurs monuments d'importance. Jhunjhunu s'enorgueillit encore aujourd'hui d'établissements remarquables parmi lesquels les haveli Mohanlal Ishwardas Modi, Kaniram Narsinghdas Tibrewala, le Khetri Maha. On dénombre également les cénotaphes ayant accueilli les cendres d'une grande partie des Singh, descendants du maharaja de Bikaner. Mais le site qui attire les touristes en nombre est le temple Rani Sati, l'un des plus importants du Rajasthan. La ville compte aujourd'hui 130 000 habitants et sa population se démultiplie lors du grand pèlerinage hindou au temple Rani Sati, très populaire dans tout le nord de l'Inde. Capitale de la région, elle est la mieux desservie en termes de transports.