Khojand serait la mythique Alexandria Eskhate que fonda Alexandre le Grand au IV^e siècle avant J.-C. Son emplacement aux portes de la fertile vallée du Ferghana sur la principale route commerçante attira une multitude de prétendants. Elle fut successivement conquise et détruite par les Arabes en 711, par Gengis Khan en 1220, puis, aux XVIII^e et XIX^e siècles, elle devint un enjeu permanent entre le khanat de Boukhara et le khanat de Kokand. Elle fut incorporée à l'Empire russe en 1866.

Deuxième ville du Tadjikistan, Khojand, connue sous le nom de Leninabad jusqu'en 1991, est aujourd'hui le centre économique et industriel de la région. Ville tadjike peuplée en grande majorité d'Ouzbeks, elle est une parfaite illustration du pervers découpage des frontières des républiques d'Asie centrale planifié par Staline. Au début du siècle, la ville possédait 198 mosquées et 20 madrasas. Il n'en reste évidemment plus qu'une infime partie, mais l'intérêt de la ville est largement rehaussé par son bazar.