Chora, aussi appelée Samothraki, est la capitale de l'île. Elle est située dans les terres, sur les hauteurs, comme souvent dans ces îles longtemps soumises aux incursions de divers pirates et envahisseurs. Elle est bâtie en amphithéâtre, sur un pan de montagne défendu par une forteresse byzantine, passée aux mains des Génois. Aujourd'hui, c'est une bourgade calme et jolie, à 5 km de Kamariotissa, où l'on déambule agréablement entre des maisons traditionnelles aux toits de tuiles rouges. La petite cité s'anime en soirée, autour de la place centrale qui offre une vue sublime. On y vient pour ses cafés et tavernes en terrasse, le soir à la fraîche.