À la suite d'une défaite contre Soundiata Keïta, fondateur de l'empire du Mali, les Sosso, autrefois vassaux de l'empire du Ghana, durent fuir leur royaume. Dans leur fuite vers le sud, ils suivirent le Rio Pongo. Coincés sur la rive droite du fleuve, sans jamais pouvoir la franchir, ils fondèrent le village devenu aujourd'hui Boffa. Petit port dans l'estuaire du Rio Pongo, la ville fut l'un des tout premiers sites négriers de l'Afrique de l'Ouest et s'est développée grâce à l'activité de traite. L'administration coloniale, dont le premier poste remonte à 1874, s'y installa, suivie de missionnaires, des " prêtres pionniers " qui furent enterrés sur place. Boffa est célèbre pour son église catholique Saint-Joseph, la plus vieille de Guinée. Un amphithéâtre d'une capacité de plusieurs milliers de personnes a été construit à proximité pour accueillir les fidèles qui se rendent à Boffa chaque année lors du pèlerinage marial. De nos jours, la ville a perdu de son activité surtout depuis que la route ne passe plus par le centre-ville avec la construction d'un pont sur la Fatala et la fermeture du bac. À noter : la présence de l'association Charente-Maritime Coopération qui, depuis plusieurs décennies, apporte son soutien au développement local. Par ailleurs, Boffa est entourée de forêts de palmiers impressionnants qui abritent des villages baga très typiques et traditionnels, de plages de sable blond, de petites îles encore sauvages, de ports de pêcheurs, de plantations à perte de vue, etc. À proximité du centre dans le village de Dominia se trouve également la première église anglicane de Guinée. Ce village peut être le but d'une belle balade au milieu des rizières pour finalement découvrir les vestiges du port négrier.